페퍼다인 대학교(영어: Pepperdine University)는 미국 캘리포니아주 말리부에 위치한 그리스도의 교회 재단의 사립 명문대학교이다. 캠퍼스가 태평양이 펼쳐진 말리부 해변에 위치하고 있으며, 독일, 영국, 이탈리아, 중국, 스위스, 아르헨티나에도 분교를 운영하고 있다. 1937년 설립된 크리스천 재단의 사립대학교이자 서부를 대표하는 사립명문 대학 중 한 곳으로 그리스도의 교회 계통인 사립 인문대학교 리버럴 아츠 칼리지가 전신이다.